En 1992, las principales autoridades y personas notables del Distrito de Masisea como: El Gobernador Iván Torres, el Prof. Wenceslao Paredes Angulo, el Ing. Walter Montes, representante del sector agrario, los profesores Carlos del Águila Gómez, Aroldo González Noriega, Bélgico Reyes Tuanama, encabezados por el Prof. Raúl Marden Contreras Ramírez, promovieron la creación de un Centro de Educación Superior en vasta jurisdicción. Después de nueve años de perseverantes gestiones, por fin, el 09 de febrero del 2001 mediante Resolución Ministerial Nº 0087-2001-ED se crea el Instituto de Educación Superior Tecnológico Público “Masisea”, sueño que pareció inalcanzable para muchos, pero gracias a sus gestores este sueño se convirtió en una realidad que ahora nadie discute. Creándose con la carrera profesional de Enfermería Técnica. Tuvo como primer Director por espacio de dos años al Lic. Juan López Ruíz, destacado profesional que logró organizar y conducir con eficiencia esta Institución.

En el año 2002, con la construcción de su local propio, el IST Masisea se convierte en una institución educativa de pleno crecimiento que dentro de su Plan Estratégico 2001-2005 establece un crecimiento ordenado y de acuerdo a los intereses de la comunidad local y regional.

En el año 2003 fue Director el Lic. Ronald Valles Rivera, en el 2004 y 2005 fue Director el Ing. Zoot. César Augusto Arriola Benedetti; en este año se creó la carrera Profesional de Agropecuaria, mediante Resolución Directoral Nº029-10 de febrero del 2005.

En el año 2019. Asume la dirección el Ing. Agrón. Gerson Georginhio Gama Gutierrez, gracias al apoyo del Vicariato Apostólico de Pucallpa, en articulación, se logra el proyecto de electrificación del instituto con paneles solares, permitiendo mejorar todas las áreas del instituto. En el mismo año se logra acceder al servicio de internet mediante el servicio satelital, también se logra mejorar las condiciones educativas en los salones mediante la adquisición de pizarras acrílicas y compra de herramientas de laboratorios. Además de mejorar y mantener la infraestructura del instituto gracias a presupuesto a través del programa Pronied. Se logra la perforación de un pozo de agua, permitiendo mejorar las condiciones del servicio educativo del instituto. También se logra la instalación de cámaras de seguridad. Se logra la crianza de 1000 pollos de engorde con recursos propios. La implementación del tópico institucional, en la actualidad ocupa por encargatura la dirección del Instituto. Durante el periodo 2019-2020 se logra la firma de convenios interinstitucionales (SENASA. MINAG, MUNICIPALIDAD DE MASISEA, COLEGIOS, CENTRO DE SALUD, DIRESA) con el fin de apoyar actividades educativas.